O problema estava no cálculo de frete do tema: sempre que o frete era recalculado, ele remarcava sozinho a opção padrão. Como o checkout recalcula o frete na hora que você confirma o endereço, a escolha do cliente (“Turbo”) acabava sendo trocada pela padrão (“Flash”).
Ajustei para guardar a opção que o cliente escolheu e manter ela até o final. A seleção automática só acontece se ele ainda não tiver escolhido nada, ou se a opção escolhida não estiver mais disponível para aquele CEP.
Se puder testar, de preferência numa aba anônima, pra não pegar cache. Qualquer coisa é só chamar!