Olá lojista, tudo bem?
Para alterar a cor de fundo da forma de envio escolhida, com o intuito de dar um destaque a mais na escolha, acesse o seu editor css em Layout > Inserir Código > CSS e coloque o código abaixo, lembre-se de trocar pela sua cor hexadecimal:
.shipping-calculator__services .list-group-item.list-group-item-action.active {
background: #012E61;
border-color: #012E61
}